Que regarder avant de choisir un logiciel de comptabilité ?
Un logiciel de comptabilité vous accompagne des années, et vos pièces doivent être conservées plus longtemps encore. Regardez donc au-delà du prix : facturation électronique, fichier FEC et ce que vous emportez si vous changez.
Prix selon votre volume
Beaucoup d'offres limitent le nombre d'écritures, de factures ou d'utilisateurs. L'offre la moins chère ne l'est plus si vous devez passer au niveau supérieur pour la banque ou l'export.
Demandez au prestataire
Combien coûte l'offre avec synchronisation bancaire et export pour mon expert-comptable, au volume que j'ai chaque mois ?
Trier par prix le plus bas6 sur 6 outils affichent un prix public
Facturation électronique et Factur-X
Depuis le 1er septembre 2026, toute entreprise en France doit pouvoir recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée. Les PME et micro-entreprises devront aussi en émettre à partir du 1er septembre 2027.
Demandez au prestataire
Le logiciel reçoit-il et émet-il des factures Factur-X via une plateforme agréée, et laquelle ?
Voir les outils avec Factur-X4 sur 6 outils remplissent ce point
Fichier des écritures comptables (FEC)
Si vous tenez une comptabilité informatisée, vous devez remettre un FEC dans un format fixé lors d'un contrôle fiscal. Votre logiciel doit savoir le produire.
Demandez au prestataire
Le logiciel génère-t-il le FEC au format réglementaire, sans module payant ?
Voir les outils avec le fichier FEC6 sur 6 outils remplissent ce point
Conservation et export
La durée de conservation fiscale passe de 6 à 10 ans pour les documents dont le délai expire après le 1er janvier 2027. Si vous changez de logiciel, vous devez pouvoir emporter ou consulter vos anciennes écritures.
Demandez au prestataire
Puis-je exporter toutes mes écritures et pièces dans un format ouvert, et y accéder après la résiliation ?
Nous n'avons pas encore de filtre pour ce point. Demandez au prestataire.
Données dans l'UE et contrat de sous-traitance
Votre comptabilité contient des données de clients et de fournisseurs. Le prestataire les traite pour vous : le RGPD impose alors un contrat de sous-traitance, et des données dans l'UE vous évitent d'examiner un transfert hors de l'Union.
Demandez au prestataire
Où sont stockées mes données, et où trouver le contrat de sous-traitance et la liste des sous-traitants ?
Voir les outils avec des données dans l'UE et un contrat de sous-traitance3 sur 6 outils remplissent ce point
Intégrations avec la banque et votre expert-comptable
Une synchronisation bancaire et une connexion avec l'outil de votre expert-comptable vous évitent les ressaisies et les envois de fichiers.
Demandez au prestataire
Avec quelles banques et quels outils d'expert-comptable le logiciel se connecte-t-il directement ?
Trier par nombre d'intégrations2 sur 6 outils citent des intégrations
Questions fréquentes sur le choix des logiciels de comptabilité
Que regarder avant de choisir un logiciel de comptabilité ?
Regardez surtout : prix selon votre volume, facturation électronique et Factur-X, fichier des écritures comptables (FEC), conservation et export, données dans l'UE et contrat de sous-traitance et intégrations avec la banque et votre expert-comptable. Pour chaque point, nous expliquons pourquoi il compte et quelle question poser au prestataire.
Quelles questions poser à un prestataire de logiciels de comptabilité ?
Combien coûte l'offre avec synchronisation bancaire et export pour mon expert-comptable, au volume que j'ai chaque mois ? Le logiciel reçoit-il et émet-il des factures Factur-X via une plateforme agréée, et laquelle ? Le logiciel génère-t-il le FEC au format réglementaire, sans module payant ? Puis-je exporter toutes mes écritures et pièces dans un format ouvert, et y accéder après la résiliation ?
Combien de logiciels de comptabilité du guide pouvez-vous utiliser ou essayer gratuitement ?
Notre guide compte 6 logiciels de comptabilité. Selon le site du prestataire, 4 ont une version gratuite et 4 un essai gratuit.
Sources
- Service Public Entreprendre : Comment se mettre en conformité avec l'obligation de facturation électronique ?
- impots.gouv.fr : Facturation électronique et plateformes agréées
- impots.gouv.fr : Fichiers standards des écritures comptables (art. L. 47 A-1 du LPF)
- Service Public Entreprendre : Modification de la durée de conservation des documents fiscaux
- Service Public Entreprendre : Quelles sont les durées de conservation des documents ?
- EUR-Lex : Règlement général sur la protection des données (RGPD), art. 28
Textes et sources vérifiés le . Les chiffres découlent des faits du guide. Les règles peuvent changer ; la source fait foi. Ceci est une explication, pas un conseil juridique ou fiscal.
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